Définition
La consanguinité entre deux animaux (ou humains) est la proportion d'allèles identiques par descendance, il s'agit donc d’un pourcentage. Par exemple, deux clones ou deux vrais jumeaux sont parfaitement consanguins (100%). Ils ne sont pas pour autant identiques : les empreintes digitales de jumeaux diffèrent, par exemple.

Interprétation
La consanguinité est considérée comme raisonnable jusqu'à 10%.
Elle est rapprochée entre 10 et 20 %.
La valeur de 20% est considérée comme la limite supérieure : au-delà, il s'agit d'une consanguinité forte.

Exemples
Père x fille ou Mère x fils = 25%
Frère x Sœur = 25 %
1/2 frère x 1/2 sœur = 12.5%
Cousins germains = 6.25%
Oncle x nièce ou Tante x neveu = 12.5%
Grands-parents x petit(e) fils(le) =12.5%

Le calcul
Le taux de consanguinité est un valeur qui se calcule entre deux animaux, c'est une valeur utile quand on veut faire une portée. Le taux de consanguinité entre deux animaux est précisément la somme des taux de consanguinité sur chaque ancêtre commun ; le taux de consanguinité pour un ancêtre commun se calcule ainsi :

S(1/2^(P+M+1))

P = Nombre de générations entre le père et l'ancêtre commun
M = Nombre de générations entre la mère et l'ancêtre commun

S représente la somme des "chaînes de parenté" : dans la pratique, une chaîne de parenté est le chemin qui part d'un des parents et remonte vers l'ancêtre commun puis redescend vers l'autre parent.

Exemple
Imaginons que l'on veut faire une portée entre Ratouni et Ratoune.

Note : les lignes en pointillés représentent les chaînes de parentés

Taux de consanguinité sur Ratouna
Ratouna -> Ratouni (p=1) -> Ratoune -> Ratouna (m=1)
Ratouna -> Ratoutou -> Ratouni (p=2) -> Ratoune -> Ratouna (m=1)

Donc le taux vaut : 1/(2^3) + 1/(2^4) = 18,75%

Taux de consanguinité sur Ratata
Ratata > Ratoutou > Ratouni (p=2) > Ratoune > Ratatouille > Ratata (m = 2)

Donc le taux vaut 1/(2^5) = 3,125%

Ainsi pour cette portée le taux de consanguinité est de 21.875%